Возврастные отличия бактериального состава рубца северных оленей Российской Арктики.
Оленеводство относится к стратегически значимой отрасли, связанной с обеспечением населения Арктических регионов нашей страны продовольствием. Поэтому актуальной задачей является углубление сведений об особенностях адаптационных приспособлений северных оленей. Важную роль в жизнедеятельности Rangifer tarandus играют микроорганизмы-симбионты рубца, позволяющие животным эффективно использовать скудные питательные ресурсы тундры и лесотундры. Однако микробное сообщество рубца северных оленей, а также его возрастные изменения являются наименее изученными по сравнению с другими жвачными. В настоящем исследовании впервые представлены результаты сравнительного анализа состава бактериального сообщества рубца телят (4 месяца), молодняка (1–2 года) и взрослых особей (3–6 лет) Rangifer tarandus Российской Арктики. Образцы содержимого рубца отбирали в летне-осенний период в 2017 году от трех животных из каждой возрастной группы в Ямало-Ненецком автономном округе. Состав бактериального сообщества рубца северных оленей анализировали в лаборатории компании «БИОТРОФ+» методом Т-RFLP (Terminal restriction fragment length polymorphism). Общий спектр выявляемых у молодняка и взрослых особей северных оленей филотипов бактерий был высоким и более разнообразен по сравнению с 4-месячными телятами (Р < 0,05). Большая часть филотипов относилась к филуму Firmicutes, в меньшей степени — Bacteroidetes, Actinobacteria и Proteobacteria, в минорном количестве — Tenericutes и Fusobacteria, Acidobacteria, Cyanobacteria. Выявлено значительное содержание неидентифицируемых филотипов, наибольшее количество которых детектировано у молодняка (Р < 0,05). В процессе онтогенеза у животных наблюдались значимые изменения представленности микроорганизмов, наибольшие из которых отмечены для микроорганизмов, принимающих участие в ферментации углеводов кормов. Содержание целлюлозолитических бактерий класса Clostridia и кислот-утилизирующих видов класса Negativicutes снижалось с возрастом (Р < 0,05), а бактерий с амило- и целлюлозолитическими свойствами филума Bacteroidetes, напротив, увеличивалось (Р < 0,05). У северных оленей выявлен широкий спектр микроорганизмов, которые традиционно относятся к возбудителям различных заболеваний животных и человека. С возрастом у животных отмечена тенденция к увеличению представленности ряда патогенов, включая бактерии семейств Campylobacteraceae, Burkholderiaceae, филума Fusobacteria, рода Staphylococcus. Наибольшая доля условно-патогенных микроорганизмов, включая актиномицеты филума Actinobacteria и семейства Enterobacteriacea, выявлялась у молодняка.
Ключевые слова:
северные олени, Rangifer tarandus, микробиом рубца, бактериальное сообщество, молекулярно-генетические методы, T-RFLP-анализ, онтогенез, летне-осенний период, Российская Арктика.